Молодой человек скончался 28 января 2012 года. Полицейские задержали его на улице, поскольку сочли его поведение неадекватным: по официальным данным, Антон шел по проезжей части, размахивая руками. Молодого человека доставили в отделение МВД — в помещение полиции №5 МО МВД России «Красноярское». Он почувствовал себя плохо, и, несмотря на попытки медиков помочь, вскоре умер.
Смерть молодого человека вызвала большой общественный резонанс. Его родственники утверждают, что Антона избили полицейские. В блоге, посвященном трагическим событиям, утверждается следующее: «Когда тело Антона приехали забирать в морг, на его лице невооруженным взглядом были видны побои, на руках кровавые следы от наручников, сломанный нос и челюсть, следы от скотча на ногах».
Позже эксперты предварительно высказались о том, что телесные повреждения в области головы, нижних конечностей и лопаточной области слева могли быть получены им в результате движения по полу с застегнутыми за спину наручниками и связанными скотчем ногами.
В ходе судебно-медицинского исследования у Шаферова обнаружено кровоизлияние в области рефлексогенной зоны чревного сплетения, которое возникло от травматического воздействия в область живота и повлекло тяжкий вред здоровью. При указанной травме моментально наступает остановка деятельности жизненно важных органов, пояснили в управлении СК РФ по региону.
Известно, что 28 января прибывший по вызову в полицию фельдшер, осмотрев Антона Шаферова, вызвала психиатрическую бригаду, сотрудники которой решили его госпитализировать. В этот момент состояние мужчины стало резко ухудшаться и у него произошла остановка дыхания. Проводимые реанимационные мероприятия положительных результатов не принесли. В настоящее время проводятся следственные действия и оперативно-розыскные мероприятия, направленные на установление всех обстоятельств совершенного преступления. На причастность к совершению данного преступления проверяются сотрудники психиатрической бригады, проводившие с Шаферовым медицинские манипуляции непосредственно.